《메탈슬러그 4》는 시리즈의 하드코어 슈팅 경험을 유지하면서 새로운 메커니즘을 추가하여 게임의 재미를 높이려고 시도했습니다. 게임의 이야기는 《메탈슬러그 3》의 1년 뒤, 마르코와 피오가 새로운 팀원인 나디아와 트레버와 함께 임무를 수행하는 내용을 담고 있습니다.
본작의 가장 눈에 띄는 개선점은 뱃지 득점 시스템입니다. 레벨에서 플레이어는 "뱃지"를 획득하여 카운트다운 보너스 시간을 활성화할 수 있습니다. 이 시간 안에 적을 연속으로 처치하면 점수가 배가되어 플레이어가 적극적으로 공격하고 빠르게 적을 제거하도록 장려하며, 높은 점수를 추구하는 플레이어에게 새로운 도전 과제를 제공합니다.
핵심적인 게임 플레이는 변하지 않았지만, 본작은 강력한 쌍권총 기관총과 같은 다양한 신규 무기와 새로운 탈것을 도입하여 전장의 화력 배치를 더욱 풍부하게 만들었습니다. 또한 게임 진행 과정에서 시리즈의 고전적인 숨겨진 분기 루트와 변신 메커니즘도 유지했습니다. 예를 들어, 플레이어는 특정 상황에서 침략당해 고릴라로 변신하여 독특한 공격 방식을 얻어 긴장된 전투에 유머 요소를 더할 수 있습니다.