本作は『X-MEN VS. STREET FIGHTER』に続くクロスオーバー作品であり、選択可能なキャラクターの範囲をさらに広げ、より多くのマーベルの代表的なキャラクターを対戦ラインナップに加え、同時に『ストリートファイター』シリーズの象徴的なキャラクターも残しています。ゲームの核となるメカニズムは2対2のチームバトルで、プレイヤーは2人のキャラクターを選択してチームを構成し、戦闘中にいつでも交代することができます。出場していない待機中のキャラクターはゆっくりと体力回復します。最も注目すべき革新は「チームメイト援護」システムで、プレイヤーは待機中のキャラクターを呼び出して一度補助攻撃を行うことができ、コンボの組み合わせと戦術の変化を広げます。さらに、ゲームはさまざまな強力なチームコラボレーション技を提供しており、たとえば「援護合撃」は、2人のキャラクターが同時に超必殺技を発動し、非常に迫力のあるシーンを演出します。このハイペースで自由度の高いコンボシステムと革新的なチームメカニズムは、その後の「Marvel vs. Capcom」シリーズゲームの基調を確立し、格闘ゲーム界に革命的な体験をもたらしました。